RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	NR2F1	P10589	423 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	CKMT1A	P12532	417 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SPN	P16150	400 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	C5AR1	P21730	350 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SOX18	P35713	384 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	WAS	P42768	502 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	CRYBB2	P43320	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	TNFRSF4	P43489	277 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	RAB28	P51157	221 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	XK	P51811	444 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ERVK-21	P61565	698 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	GPLD1	P80108	840 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	PLAUR	Q03405	335 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	FUT5	Q11128	374 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	CBX3	Q13185	183 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	GINS1	Q14691	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	IRF4	Q15306	451 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	CEBPE	Q15744	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	GPR19	Q15760	415 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	CST6	Q15828	149 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	RPE65	Q16518	533 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	TTL	Q8NG68	377 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	KLK6	Q92876	244 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ARHGDIG	Q99819	225 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IFT122-231	ENST00000514275	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.69	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms