RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SYT14Q8NB59 555 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM163Q8TC26 289 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 COX14Q96I36 57 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 NT5DC2Q9H857 520 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 BCL2L10Q9HD36 194 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 IRAK3Q9Y616 596 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0A6YYD5 115 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM129A0AVI4 362 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SEC14L5O43304 696 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 FKTNO75072 461 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 GSTM3P21266 225 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MAN2A2P49641 1150 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TPBGQ13641 420 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ADCK2Q7Z695 626 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MED18Q9BUE0 208 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 PRR14Q9BWN1 585 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 LGR4Q9BXB1 951 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SAP130Q9H0E3 1048 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 NOX1Q9Y5S8 564 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC30A4O14863 429 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 DRD2P14416 443 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SSR2P43308 183 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MTNR1AP48039 350 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 PRMT2P55345 433 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC27A4Q6P1M0 643 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC01555Q8NAE3 123 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 BBS10Q8TAM1 723 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TOR4AQ9NXH8 423 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MYO10Q9HD67 2058 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 C5orf42Q9H799 3197 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A087WUU8 490 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SSTR4P31391 388 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC6A11P48066 632 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CSNK1G2P78368 415 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 UBE3AQ05086 875 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 FUT5Q11128 374 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MADCAM1Q13477 382 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM52BQ4KMG9 183 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 PYDC2Q56P42 97 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRTM4Q86VH4 590 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 OR52P1PQ8NH57 321 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SNTNA6NMZ2 147 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA0355O15063 1070 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ALPPL2P10696 532 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGEF6Q15052 776 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF793Q6ZN11 406 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2J2Q8N2K1 259 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 BBS4Q96RK4 519 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM245Q9H330 911 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 LRIT2A6NDA9 550 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 KHKP50053 298 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC36A4Q6YBV0 504 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF730Q6ZMV8 503 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 RDH10Q8IZV5 341 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TEX47Q8TBZ9 253 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CXorf40AQ8TE69 158 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 AICDAQ9GZX7 198 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 B4DXG7 233 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MAN2B1O00754 1011 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CSF2P04141 144 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAPPC2P0DI81 140 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAPPC2BP0DI82 140 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF24P17028 368 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CAV3P56539 151 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 FABP5Q01469 135 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SHFQ7M4L6 423 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKK1Q8NFD2 765 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SUN3Q8TAQ9 357 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 AP3S1Q92572 193 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 UFD1Q92890 307 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TTYH2Q9BSA4 534 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRA2Q9H9E1 313 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 BOLA1Q9Y3E2 137 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 LTBP2Q14767 1821 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 NUMA1Q14980 2115 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 AGRPO00253 132 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CEBPBP17676 345 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 GJA8P48165 433 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CLCNKAP51800 687 aa25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms