RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC22A3O75751 556 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLM1Q8NBJ4 401 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 CATSPER1Q8NEC5 780 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 NPHS2Q9NP85 383 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 UPK1AO00322 258 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 EMC8O43402 210 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 C1QL1O75973 258 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SOX30O94993 753 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 IL6P05231 212 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 NAGAP17050 411 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 S100A3P33764 101 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PTGER1P34995 402 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF766Q5HY98 468 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 BHLHB9Q6PI77 547 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM64Q6YI46 380 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 RTL4Q6ZR62 310 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 BTBD9Q96Q07 612 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ITPAQ9BY32 194 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 CSAG2Q9Y5P2 127 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 FRG2CA6NGY1 282 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A12O75746 678 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 NEURL1O76050 574 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PSMG1O95456 288 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 F10P00742 488 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PRB1P04280 392 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXO45P0C2W1 286 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SOX3P41225 446 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP4BP51164 291 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 UFM1P61960 85 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 RPP38P78345 283 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 DUSP8Q13202 625 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS26BQ4G0F5 336 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A25Q6KCM7 469 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SCMH1Q96GD3 660 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 VSTM2LQ96N03 204 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 EBF4Q9BQW3 602 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 FOLH1BQ9HBA9 442 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD10Q9NXR5 420 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 TO15178 435 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 CFLARO15519 480 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ERN1O75460 977 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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SH3BP2-212ENST00000508338 SP1P08047 785 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM198Q66K66 360 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SPINK14Q6IE38 97 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4F3Q6IEY1 312 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 IL20RBQ6UXL0 311 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 Q8NA96 180 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 OR56A1Q8NGH5 318 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SFXN5Q8TD22 340 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 RILPQ96NA2 401 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 MS4A4EQ96PG1 132 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 DCTN4Q9UJW0 460 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A0G2JND7 137 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 TTLL8A6PVC2 850 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 OR6B1O95007 311 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK9P50750 372 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SPANXN4Q5MJ08 99 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 NUP43Q8NFH3 380 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 BTNL2Q9UIR0 455 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 TP53I11O14683 189 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 NME2P1O60361 137 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 C6orf47O95873 294 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 PGRP06401 933 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT16P08779 473 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 NME2P22392 152 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 NME5P56597 212 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 MAPKAPK3Q16644 382 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 CDRT4Q8N9R6 151 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGED4Q96JG8 741 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-212ENST00000508338 DTX4Q9Y2E6 619 aa24.76■■□□□ 1.55
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