RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CREBBPQ92793 2442 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RGS14O43566 566 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 FTCDO95954 541 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 POU2F1P14859 743 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CRABP2P29373 138 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CRADDP78560 199 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 HMGCS1Q01581 520 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CUL1Q13616 776 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 LCA5Q86VQ0 697 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 FAM47BQ8NA70 645 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CPNE1Q99829 537 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 OR10A5Q9H207 317 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 NTMQ9P121 344 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 SEC16AO15027 2179 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 SYCE1LA8MT33 242 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 PRAMEF4O60810 478 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TNNI3P19429 210 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 IVDP26440 423 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ABCD3P28288 659 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TRABD2AQ86V40 505 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 IFNEQ86WN2 208 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 HPS1Q92902 700 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ADGRG7Q96K78 797 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 REG4Q9BYZ8 158 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 COL12A1Q99715 3063 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 CR1P17927 2039 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 A0A087X1B8 175 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PQD3 144 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 OR2W5A6NFC9 320 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 VWC2LB2RUY7 222 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 STX16O14662 325 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 ZIC3O60481 467 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 THBDP07204 575 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 CPMP14384 443 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 KRT15P19012 456 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 ADH6P28332 368 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 SLCO1A2P46721 670 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 SLAMF1Q13291 335 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 P2RY6Q15077 328 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 DCST1Q5T197 706 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 METTL4Q8N3J2 472 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 OR7G3Q8NG95 312 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 LINC01560Q8TB33 94 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 PGM2Q96G03 612 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 PROCRQ9UNN8 238 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 RELNP78509 3460 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 ANK2Q01484 3957 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 A8MUA0 341 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 INAFM1C9JVW0 142 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 PLOD2O00469 737 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 PLPP1O14494 284 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 PLOD3O60568 738 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 FGGP02679 453 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 PYGBP11216 843 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 RFC3P40938 356 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.95□□□□□ -1.3
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