RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 NR4A3Q92570 626 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 MCHR2Q969V1 340 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 LIME1Q9H400 295 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 POLD4Q9HCU8 107 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA2Q9UM82 520 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CPQQ9Y646 472 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0U1RQV5 110 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 K7ERI5 159 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPT2O15123 496 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 MFN2O95140 757 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC159P0C7I6 412 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 PGFP49763 221 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B7P56937 341 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TAF3Q5VWG9 929 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 BIRC7Q96CA5 298 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC61Q9BV99 259 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TPPP3Q9BW30 176 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 GPR83Q9NYM4 423 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS7Q9Y394 339 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GUL7 405 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 RNF222A6NCQ9 220 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 LRIT2A6NDA9 550 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 WASH3PC4AMC7 463 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK13O15264 365 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ALOX15BO15296 676 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT14O95848 222 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TSPY4P0CV99 314 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TSPY10P0CW01 314 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 THRBP10828 461 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B1P14061 328 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 UCP1P25874 307 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ADRA1AP35348 466 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SAA4P35542 130 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK11-1P61568 191 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 LEG1Q6P5S2 330 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 LHX4Q969G2 390 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 WDR76Q9H967 626 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 PANK3Q9H999 370 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CTSZQ9UBR2 303 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 GHRLQ9UBU3 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TTC26A0AVF1 554 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PDLIM1O00151 329 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PDE5AO76074 875 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 LMO2P25791 158 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 HTR2AP28223 471 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ADSSP30520 456 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 RAG2P55895 527 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 HYAL1Q12794 435 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 RAPSNQ13702 412 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT17Q6IS24 598 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 APOOLQ6UXV4 268 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 VSTM2LQ96N03 204 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 IWS1Q96ST2 819 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 JPT2Q9H910 190 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 MBD2Q9UBB5 411 aa6.27□□□□□ -1.41
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