RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 SERTM1A2A2V5 107 aa25.44■■□□□ 1.66
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HOXB3-211ENST00000490677 IL3P08700 152 aa25.44■■□□□ 1.66
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HOXB3-211ENST00000490677 PTPN6P29350 595 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 HMOX2P30519 316 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 DLX5P56178 289 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 C16orf78Q8WTQ4 265 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 OMA1Q96E52 524 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 TO15178 435 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 UGT2B11O75310 529 aa25.41■■□□□ 1.66
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HOXB3-211ENST00000490677 DRD2P14416 443 aa25.41■■□□□ 1.66
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HOXB3-211ENST00000490677 MED12LQ86YW9 2145 aa25.41■■□□□ 1.66
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HOXB3-211ENST00000490677 DCDC2Q9UHG0 476 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 STK38LQ9Y2H1 464 aa25.41■■□□□ 1.66
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HOXB3-211ENST00000490677 VASNQ6EMK4 673 aa25.4■■□□□ 1.66
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HOXB3-211ENST00000490677 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
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HOXB3-211ENST00000490677 CT45A2Q5DJT8 189 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 ACSM2BQ68CK6 577 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 POMZP3Q6PJE2 187 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 OR9A2Q8NGT5 310 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 BTBD9Q96Q07 612 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 GALNT9Q9HCQ5 603 aa25.39■■□□□ 1.66
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