RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 PINLYPA6NC86 204 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM166BA8MTA8 275 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ACOX3O15254 700 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PLOD3O60568 738 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC19A2O60779 497 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SLITRK5O94991 958 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 BCKDHAP12694 445 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 NAGAP17050 411 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 DRD5P21918 477 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SOX18P35713 384 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXW4P57775 412 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNJ2P63252 427 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 DUSP8Q13202 625 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 RPS6KA2Q15349 733 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 NNATQ16517 81 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PRSS53Q2L4Q9 553 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 XKR7Q5GH72 579 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 TBCELQ5QJ74 424 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PRAMEF20Q5VT98 475 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SPPL2CQ8IUH8 684 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF781Q8N8C0 355 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 FNDC5Q8NAU1 212 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SIMC1Q8NDZ2 872 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 OR52N2Q8NGI0 321 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 CLHC1Q8NHS4 586 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 MGARPQ8TDB4 240 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 DIO2Q92813 273 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 C3orf30Q96M34 536 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 TTTY12Q9BZ98 90 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 DEFB127Q9H1M4 99 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 GLIPR2Q9H4G4 154 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRA2Q9H9E1 313 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SH2D2AQ9NP31 389 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0G2JMM0 328 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PPB8 328 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PRS3 328 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 KIR3DP1A8MWS1 328 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PDPK1O15530 556 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 COQ9O75208 318 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PDE9AO76083 593 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PRPS2P11908 318 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCD3P28288 659 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 GPC1P35052 558 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 RPL14P50914 215 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 C6orf136Q5SQH8 315 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 CES4AQ5XG92 561 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM198Q66K66 360 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 OR7G2Q8NG99 324 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFP28Q8NHY6 868 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 RELTQ969Z4 430 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 AMDHD1Q96NU7 426 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 DOHHQ9BU89 302 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 GIMAP2Q9UG22 337 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A087WV62 115 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 FRG2CA6NGY1 282 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 CCL21O00585 134 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 TBX19O60806 448 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ERN1O75460 977 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PPM1BO75688 479 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 LDLRP01130 860 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 HPCAL1P37235 193 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 RPL3P39023 403 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 CA7P43166 264 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC18A1P54219 525 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 MANFP55145 182 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 HSF1Q00613 529 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PLCXD2Q0VAA5 305 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 CMPK2Q5EBM0 449 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 IL23RQ5VWK5 629 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM107Q6UX40 140 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP54Q7Z3B4 507 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 LIX1Q8N485 282 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SPPL2AQ8TCT8 520 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 TLCD1Q96CP7 247 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 MTERF3Q96E29 417 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 OMA1Q96E52 524 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf50Q9BV19 199 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 FOLH1BQ9HBA9 442 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF835Q9Y2P0 537 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.9 ms