RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 GGHQ92820 318 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 YIPF6Q96EC8 236 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 MS4A4EQ96PG1 132 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 AMBNQ9NP70 447 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 GIN1Q9NXP7 522 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SLC22A7Q9Y694 548 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 A0A1B0GVG6 124 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ALPPP05187 535 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 NUDT6P53370 316 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OLR1P78380 273 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 AQP6Q13520 282 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SPCS2Q15005 226 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OR7G2Q8NG99 324 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TBC1D15Q8TC07 691 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 LYRM4Q9HD34 91 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 NTMQ9P121 344 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 A0A1W2PPC4 97 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF860A6NHJ4 632 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 DUXAA6NLW8 204 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 M0R129 80 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CDK1P06493 297 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CHRNB1P11230 501 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CNR2P34972 360 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 BLKP51451 505 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CHRNEQ04844 493 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ILKQ13418 452 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF311Q5JNZ3 666 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FAM111BQ6SJ93 734 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PTCHD4Q6ZW05 846 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OOSP2Q86WS3 158 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OR4N5Q8IXE1 308 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PRRC1Q96M27 445 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SPACA6W5XKT8 324 aa16.11■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SYT5O00445 386 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJB6O75190 326 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ENTPD1P49961 510 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 C1orf61Q13536 156 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FAM214AQ32MH5 1076 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 MANEAQ5SRI9 462 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 MFSD12Q6NUT3 480 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 USP53Q70EK8 1073 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PARGQ86W56 976 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 LINC00471Q8N535 108 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TSTD1Q8NFU3 115 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TANKQ92844 425 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 GPR83Q9NYM4 423 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SH3D21A4FU49 640 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OR5K3A6NET4 321 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SLITRK5O94991 958 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 AGR2O95994 175 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 LCKP06239 509 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CPMP14384 443 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 HHEXQ03014 270 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CDC73Q6P1J9 531 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 STX19Q8N4C7 294 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ABHD8Q96I13 439 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OCEL1Q9H607 264 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CLN6Q9NWW5 311 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PTGFRNQ9P2B2 879 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SLC6A14Q9UN76 642 aa16.1■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa16.09■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SLC22A1O15245 554 aa16.09■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SOX14O95416 240 aa16.09■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PORP16435 677 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TDGQ13569 410 aa16.09■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa16.09■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.09■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OR2L13Q8N349 312 aa16.09■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms