RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469602.1

SRRT-208, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-208ENST00000469602 G3V3Y1 287 aa8.96□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 AKAP10O43572 662 aa8.96□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 ASNA1O43681 348 aa8.96□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 TBX19O60806 448 aa8.96□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 LRATO95237 230 aa8.96□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.982e-8■■□□□ 13.6
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SRRT-208ENST00000469602 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 MC3RP41968 323 aa8.95□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 FBXW4P57775 412 aa8.95□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 PLGLB1Q02325 96 aa8.95□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 IL23RQ5VWK5 629 aa8.95□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.95□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 OR2L13Q8N349 312 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 FBXW8Q8N3Y1 598 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.95□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 ARL8AQ96BM9 186 aa8.95□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.95□□□□□ -0.98
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SRRT-208ENST00000469602 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 A0A1B0GUH1 482 aa8.94□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.94□□□□□ -0.98
SRRT-208ENST00000469602 FRG2CA6NGY1 282 aa8.94□□□□□ -0.98
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