RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF385B	Q569K4	471 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	LYPD8	Q6UX82	237 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GRHL3	Q8TE85	626 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	KAT2A	Q92830	837 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	VSTM2L	Q96N03	204 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CNIH4	Q9P003	139 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TP53I11	O14683	189 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	KIT	P10721	976 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	DIO3	P55073	304 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP8	Q13202	625 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	RPS6KA2	Q15349	733 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	DOK4	Q8TEW6	326 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NR4A3	Q92570	626 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MOAP1	Q96BY2	351 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	DPY30	Q9C005	99 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OLAH	Q9NV23	265 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	AIG1	Q9NVV5	245 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PRB8	838 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	UPK1A	O00322	258 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF195	O14628	629 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241		P04436	131 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	EDN3	P14138	238 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	IDO1	P14902	403 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CNR1	P21554	472 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ABCD3	P28288	659 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	EPHA3	P29320	983 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MC3R	P41968	323 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	HSPB3	Q12988	150 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GSTA3	Q16772	222 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	COLEC12	Q5KU26	742 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM107	Q6UX40	140 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM64	Q6YI46	380 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GK5	Q6ZS86	529 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MDGA2	Q7Z553	956 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SLC34A3	Q8N130	599 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TAAR6	Q96RI8	345 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP26	Q9BV47	211 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ITPA	Q9BY32	194 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL1	Q9NR64	748 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NIN	Q8N4C6	2090 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	EMC8	O43402	210 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PEX1	O43933	1283 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PPM1B	O75688	479 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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