RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	HYKK	A2RU49	373 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	ALOX15B	O15296	676 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	MID1	O15344	667 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	AP5Z1	O43299	807 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	PI15	O43692	258 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CLDN14	O95500	239 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	ACSL3	O95573	720 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	F3	P13726	295 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	PRKACA	P17612	351 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	AOC1	P19801	751 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	PTN	P21246	168 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	HOXA6	P31267	233 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	SERPINB6	P35237	376 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	HSD17B3	P37058	310 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	PSMD7	P51665	324 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	KDSR	Q06136	332 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105		Q0VFX4	171 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	TROAP	Q12815	778 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CUL3	Q13618	768 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CDO1	Q16878	200 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105		Q75L30	129 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	NSMAF	Q92636	917 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	ASCL2	Q99929	193 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	CITED1	Q99966	193 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM2-208	ENST00000432105	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.49	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms