RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 GUCD1Q96NT3 240 aa21.74■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 THADAQ6YHU6 1953 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 PCDH15Q96QU1 1955 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.74■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 MANEAQ5SRI9 462 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 AHCYL1O43865 530 aa21.73■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 OR2L13Q8N349 312 aa21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 FAM81AQ8TBF8 368 aa21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 ISOC1Q96CN7 298 aa21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa21.73■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 DMDP11532 3685 aa21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 M0R129 80 aa21.73■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 TMCC3Q9ULS5 477 aa21.73■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 I3L1I5 382 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 MAPK10P53779 464 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 FAM214AQ32MH5 1076 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF628Q5EBL2 1059 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF311Q5JNZ3 666 aa21.72■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 TGM7Q96PF1 710 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 BTBD2Q9BX70 525 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 DGCR6LQ9BY27 220 aa21.72■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 GIN1Q9NXP7 522 aa21.72■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 LGI1O95970 557 aa21.72■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 TMEM236Q5W0B7 351 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL17Q6TDP4 642 aa21.72■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 EML5Q05BV3 1969 aa21.71■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.078e-10■■■■□ 24.4
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP5Q16690 384 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 DCST1Q5T197 706 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SLC7A13Q8TCU3 470 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 NTMQ9P121 344 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.71■■□□□ 1.07
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