RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 IKQ13123 557 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM53BQ14153 422 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADCK5Q3MIX3 580 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASC10Q5T4H9 136 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf63Q6NUN7 778 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEPROQ6NW34 567 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLEC4GQ6UXB4 293 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPBP1Q86WP2 473 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP57L1Q8IYX8 460 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PYROXD2Q8N2H3 581 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELMOD1Q8N336 334 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10G4Q8NGN3 311 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR9A1PQ8NGU1 263 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCAMP5Q8TAC9 235 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MUC7Q8TAX7 377 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIPHQ8WWY8 451 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCED1BQ96HM7 432 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASL11BQ9BPW5 248 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF286AQ9HBT8 521 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF160Q9HCG1 818 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNRD1Q9P1U0 126 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRCH1Q9Y2L9 728 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFT52Q9Y366 437 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMCO5BA8MYB1 307 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ODF3BA8MYP8 253 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC188H7C350 402 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 EFNA2O43921 213 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLOD3O60568 738 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSPAN9O75954 239 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNE2O96020 404 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOSP00540 346 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OXTP01178 125 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2ABP04908 130 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT18P05783 430 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTSGP08311 255 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF18P17022 549 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2ADP20671 130 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGFBP5P24593 272 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTAFRP25105 342 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPM1AP35813 382 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CETN2P41208 172 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSH2P43246 934 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1D4P47884 311 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTG1P62324 171 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SP4Q02446 784 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD164Q04900 197 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYCNQ0VAF6 134 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRB7Q14451 532 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MELKQ14680 651 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT31Q15323 416 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA0753Q2KHM9 967 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4A47Q6IF82 309 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 LGI3Q8N145 548 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 KDM8Q8N371 416 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q8N6K4 173 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 C15orf56Q8N910 161 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRTM2Q8N967 370 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATG16L2Q8NAA4 619 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 C15orf53Q8NAA6 179 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF740Q8NDX6 193 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4C15Q8NGM1 316 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNRF2Q8NHG8 242 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 UCN3Q969E3 161 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF566Q969W8 418 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDHR1Q96JP9 859 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 DACH2Q96NX9 599 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TXN2Q99757 166 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSSK1BQ9BXA7 367 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBA5Q9GZZ9 404 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP62CLQ9H1M0 184 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPEP3Q9H4B8 488 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASSF1Q9NS23 344 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 NME7Q9Y5B8 376 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 APC2O95996 2303 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYCBP2O75592 4640 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLEQ07864 2286 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN4AP35499 1836 aa-1.6□□□□□ -2.67
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