RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.66□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 C7orf66A4D0T2 115 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 LINC01387J3KSC0 135 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 PIP5K1CO60331 668 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 PEX14O75381 377 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 HLA-DQB1P01920 261 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 FABP1P07148 127 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 OR4Q2P0C623 313 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 CDC42EP1Q00587 391 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 TAP2Q03519 686 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 PAQR7Q86WK9 346 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 MICALL2Q8IY33 904 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 BVESQ8NE79 360 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 SGK2Q9HBY8 427 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PPK0 400 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 PRMT3O60678 531 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 EFCAB14O75071 495 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 SOD1P00441 154 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 POMCP01189 267 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 IGHA2P01877 340 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 RLN2P04090 185 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 BCHEP06276 602 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 ADCYAP1R1P41586 468 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 VEGFCP49767 419 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 AP1S2P56377 157 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 TNFRSF17Q02223 184 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 OVCH2Q7RTZ1 564 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 OR5M3Q8NGP4 307 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 CRB3Q9BUF7 120 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 WDR26Q9H7D7 661 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 FNIP2Q9P278 1114 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 TRPC4Q9UBN4 977 aa11.65□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 C2orf78A6NCI8 922 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 DPM1O60762 260 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PRAMEF11O60813 436 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SERPINA3P01011 423 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SEMG1P04279 462 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 NMBP08949 121 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 KCNE1P15382 129 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLC3A1Q07837 685 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SMCO1Q147U7 214 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SYT14P1Q58G82 188 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 CORO6Q6QEF8 472 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 LINGO4Q6UY18 593 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLC36A4Q6YBV0 504 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 IQCHQ86VS3 1027 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 GPR26Q8NDV2 337 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 KCNJ15Q99712 375 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 GPR160Q9UJ42 338 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.65□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TO15178 435 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 FZD7O75084 574 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 CBR1P16152 277 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HOXC13P31276 330 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 XCR1P46094 333 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 GIPRP48546 466 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 CNTN1Q12860 1018 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TPBGQ13641 420 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 MPEG1Q2M385 716 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 MANEALQ5VSG8 457 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLC22A10Q63ZE4 541 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OR10K1Q8NGX5 313 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HUS1BQ8NHY5 278 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 WDR48Q8TAF3 677 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 FBXO32Q969P5 355 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 C10orf90Q96M02 699 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 EVA1AQ9H8M9 152 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00587B1AMM8 73 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 M0QZ92 97 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SAP18O00422 153 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HPXP02790 462 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RHOCP08134 193 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RORAP35398 523 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PGFP49763 221 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RPS26P62854 115 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms