RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM221A6NGB7 291 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 DNTTP04053 509 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 F3P13726 295 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CRYBB2P43320 205 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MAN2A2P49641 1150 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 EFNB1P98172 346 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CD300CQ08708 224 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SYT14P1Q58G82 188 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SMURF1Q9HCE7 757 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 FBXW2Q9UKT8 454 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SSR3Q9UNL2 185 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAPPC4Q9Y296 219 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 HYKKA2RU49 373 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SNTNA6NMZ2 147 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC32Q14392 662 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 RPE65Q16518 533 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM73Q86UV7 250 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 OR52I1Q8NGK6 324 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CHFRQ96EP1 664 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGDIGQ99819 225 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNS3Q9BQ31 491 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 INIPQ9NRY2 104 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC13A4Q9UKG4 626 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 OR52A4PA6NMU1 304 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TPST2O60704 377 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 STATHP02808 62 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 HBQ1P09105 142 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 RORCP51449 518 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CEBPEQ15744 281 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM107Q6UX40 140 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 OLIG3Q7RTU3 272 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 FGF11Q92914 225 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TXNDC15Q96J42 360 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 OR7D2Q96RA2 312 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MACROD1Q9BQ69 325 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ALPPP05187 535 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TMED10P49755 219 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 COPZ1P61923 177 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF311Q5JNZ3 666 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ACSM5Q6NUN0 579 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 FBXL6Q8N531 539 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 LRR1Q96L50 414 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD19PQ9H560 264 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CTDSP2O14595 271 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 PROM1O43490 865 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 APOA1P02647 267 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CERS1P27544 350 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 IFNA8P32881 189 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 RPS19P39019 145 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TAS2R41P59536 307 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 DUSP2Q05923 314 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAM2Q15035 370 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 C18orf63Q68DL7 685 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF425Q6IV72 752 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MRGPREQ86SM8 312 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 NUP43Q8NFH3 380 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TEX47Q8TBZ9 253 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GANCQ8TET4 914 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 C16orf58Q96GQ5 468 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A1W2PQU0 124 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 IGFALSP35858 605 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 SNAPC1Q16533 368 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF750Q32MQ0 723 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 ATAD3BQ5T9A4 648 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC36A4Q6YBV0 504 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 PHC2Q8IXK0 858 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM163Q8TC26 289 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 GPA33Q99795 319 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 APOOQ9BUR5 198 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 PRRG3Q9BZD7 231 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 CKAP5Q14008 2032 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 CYP7B1O75881 506 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 ALPPL2P10696 532 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 TNFSF8P32971 234 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-202ENST00000399409 USP30Q70CQ3 517 aa21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms