RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361530.10

CNKSR1-201, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNKSR1, Length 2,625 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-201ENST00000361530 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 MYO10Q9HD67 2058 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 A0A0A6YYD5 115 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 A0A1W2PS29 197 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 SMIM30A4D0T7 59 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 IGLON5A6NGN9 336 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 C4orf51C9J302 202 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 LATO43561 262 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 CDK3Q00526 305 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 DUSP2Q05923 314 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 C22orf42Q6IC83 251 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-201ENST00000361530 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.65□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CENPBD1B2RD01 187 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PGRMC2O15173 223 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SSR2P43308 183 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MAN2A2P49641 1150 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CDK5Q00535 292 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 GPR50Q13585 617 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TAB1Q15750 504 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TM9SF4Q92544 642 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TMCO6Q96DC7 493 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SNX18Q96RF0 628 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SRRQ9GZT4 340 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 TMEM245Q9H330 911 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ABCB9Q9NP78 766 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 DEC1Q9P2X7 70 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 LRIT2A6NDA9 550 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 RAB36O95755 333 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 LGI1O95970 557 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 IL7P13232 177 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CTNNB1P35222 781 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 COX10Q12887 443 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MLC1Q15049 377 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SNAPC1Q16533 368 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 C11orf74Q86VG3 221 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 RAB43Q86YS6 212 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 NELL2Q99435 816 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PHOX2BQ99453 314 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CMAHPQ9Y471 501 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 A0A1W2PQ09 198 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC35F4A4IF30 521 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 VEGFBP49765 207 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 RUNX1T1Q06455 604 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MADCAM1Q13477 382 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ZG16BQ96DA0 208 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 WDFY2Q96P53 400 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 NT5DC2Q9H857 520 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 OR1A2Q9Y585 309 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MAN2B1O00754 1011 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 FRS3O43559 492 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CPEP16870 476 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 PPP2R1BP30154 601 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 MAP4K2Q12851 820 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CAMK1Q14012 370 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 CDK10Q15131 360 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms