RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 IDH3BO43837 385 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 LALBAP00709 142 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 KRT8P05787 483 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TSPAN19P0C672 248 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 BCL6P41182 706 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 IL12RB1P42701 662 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 GIPRP48546 466 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 VEGFBP49765 207 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 CLDN2P57739 230 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 RAB8AP61006 207 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 DPTQ07507 201 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 LTB4RQ15722 352 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 GAB4Q2WGN9 574 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 C18orf63Q68DL7 685 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 KRT73Q86Y46 540 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 FLCNQ8NFG4 579 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TP53INP1Q96A56 240 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ARSGQ96EG1 525 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 C12orf66Q96MD2 445 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PELI2Q9HAT8 420 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF221Q9UK13 617 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 GPR34Q9UPC5 381 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 A0A087WUU8 490 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0A6YYD5 115 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PR48 441 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 FAM170BA6NMN3 283 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PIP5K1CO60331 668 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PCDH8O95206 1070 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ADH1CP00326 375 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TIMP1P01033 207 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 RB1P06400 928 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ERGP11308 486 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 CERS1P27544 350 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 AVPR1BP47901 424 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 MAN2A2P49641 1150 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 CDK3Q00526 305 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 FABP5Q01469 135 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 RUNX1T1Q06455 604 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 HYAL2Q12891 473 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 OCLNQ16625 522 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 METRNLQ641Q3 311 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 FBXL6Q8N531 539 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 FGF11Q92914 225 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ARMC5Q96C12 935 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TMCO6Q96DC7 493 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 COX14Q96I36 57 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 BBS4Q96RK4 519 aa6.84□□□□□ -1.31
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