RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 BBS4Q96RK4 519 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MEN1O00255 615 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 HAT1O14929 419 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CSO75390 466 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ALOX12P18054 663 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF91Q05481 1191 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 RUNX3Q13761 415 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KRT33BQ14525 404 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 FAM214AQ32MH5 1076 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ADAM29Q9UKF5 820 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 USP34Q70CQ2 3546 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 FAM172BPA6NC97 362 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KRT8P05787 483 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM23P36406 574 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 RAB8AP61006 207 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 IQCHQ86VS3 1027 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PSD4Q8NDX1 1056 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZG16BQ96DA0 208 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 FNDC11Q9BVV2 318 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 UCKL1Q9NWZ5 548 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 A3GALT2U3KPV4 340 aa15.42■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CA3P07451 260 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 HBQ1P09105 142 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PIPP12273 146 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SLC9A5Q14940 896 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ACSM5Q6NUN0 579 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM107Q6UX40 140 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM80Q96HE8 168 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DPP7Q9UHL4 492 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 RFXAPO00287 272 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 FRS3O43559 492 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CCNKO75909 580 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DRD2P14416 443 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TGM4P49221 684 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MLC1Q15049 377 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SPHARQ15513 63 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CADM2Q8N3J6 435 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 EQTNQ9NQ60 294 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ASB4Q9Y574 426 aa15.41■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DYRK3O43781 588 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KCNK2O95069 426 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 APOL3O95236 402 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SCG5P05408 212 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CEACAM5P06731 702 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CERS1P27544 350 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PPP2R1BP30154 601 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 GALK2Q01415 458 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PRKCDQ05655 676 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 GPM6BQ13491 265 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZIC1Q15915 447 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF181Q2M3W8 571 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KRT73Q86Y46 540 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 OR8J1Q8NGP2 316 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 RASSF5Q8WWW0 418 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TXNDC15Q96J42 360 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 NUAK2Q9H093 628 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DOCK8Q8NF50 2099 aa15.4■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PRQ8 180 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms