RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323076.6

LCP1-201, Transcript of lymphocyte cytosolic protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LCP1, Length 3,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1-201ENST00000323076 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 FDX2Q6P4F2 183 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 BEST4Q8NFU0 473 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 OR5J2Q8NH18 312 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 THAP6Q8TBB0 222 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 LRCH3Q96II8 777 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 V9GYQ6 96 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CENPFP49454 3210 aa6.64□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 DISC1C4P0D8 188 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TSTD3H0UI37 97 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SURF4O15260 269 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 OR10H3O60404 316 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PLIN3O60664 434 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 FMO6PO60774 539 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 G6PDP11413 515 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ANXA3P12429 323 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 DNASE1P24855 282 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ABCD3P28288 659 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SSTR4P31391 388 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 FLT3LGP49771 235 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 KCNQ1P51787 676 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 EPHB3P54753 998 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CXCR4P61073 352 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ZNF691Q5VV52 312 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TTC23Q5W5X9 447 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ORC5O43913 435 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CCL5P13501 91 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 AVPR2P30518 371 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 RGS6P49758 472 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 LIMK2P53671 638 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 MARC1Q5VT66 337 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CCDC107Q8WV48 283 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CHST5Q9GZS9 411 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ABCB9Q9NP78 766 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 GCNT4Q9P109 453 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 IL17BQ9UHF5 180 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SYT5O00445 386 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 VPS26AO75436 327 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PIGRP01833 764 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PMP2P02689 132 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 OR56A5P0C7T3 313 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CXCL2P19875 107 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NPBWR1P48145 328 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CYP2J2P51589 502 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TWF1Q12792 350 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NPRL3Q12980 569 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 LCN8Q6JVE9 175 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 FTMTQ8N4E7 242 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 THRSPQ92748 146 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ISL2Q96A47 359 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 HMCESQ96FZ2 354 aa6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms