RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 SOSTQ9BQB4 213 aa20.48■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 WACQ9BTA9 647 aa20.48■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 MED18Q9BUE0 208 aa20.48■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 SAP130Q9H0E3 1048 aa20.48■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 LHX9Q9NQ69 397 aa20.48■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.48■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 A0A1W2PRQ8 180 aa20.47■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 C12orf71A8MTZ7 269 aa20.47■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 ISM1B1AKI9 464 aa20.47■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 NR2F1P10589 423 aa20.47■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 TYRP14679 529 aa20.47■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 BSGP35613 385 aa20.47■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 GON7Q9BXV9 100 aa20.47■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 A0A1B0GVC2 190 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 A6NIN4 97 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 GLOD5A6NK44 160 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 GABRA5P31644 462 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 MTNR1AP48039 350 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 FAM129CQ86XR2 697 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 AP3S1Q92572 193 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 TRIM63Q969Q1 353 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 TAC3Q9UHF0 121 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 HSPB11Q9Y547 144 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 HRO43593 1189 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 PDE9AO76083 593 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 MMP12P39900 470 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 PPP3R1P63098 170 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 ABATP80404 500 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 KLHL22Q53GT1 634 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 DPPA4Q7L190 304 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 TMEM163Q8TC26 289 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 KLHL21Q9UJP4 597 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.46■□□□□ 0.87
ELL3-201ENST00000319359 TGM5O43548 720 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 CELP19835 753 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 SDHBP21912 280 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 EVX1P49640 407 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 QRFPRQ96P65 431 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 IL36AQ9UHA7 158 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 ASF1AQ9Y294 204 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 TMEM129A0AVI4 362 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 PRODHO43272 600 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 TSC22D2O75157 780 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 OR2B3O76000 313 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 HLA-DQB1P01920 261 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 CHRM4P08173 479 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 ARSBP15848 533 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 SMSP52788 366 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 RAB40BQ12829 278 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 C1orf94Q6P1W5 598 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 ZNF485Q8NCK3 441 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 BBS1Q8NFJ9 593 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 TMEM43Q9BTV4 400 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 RNF32Q9H0A6 362 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.45■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 A0A087WUU8 490 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 LANCL1O43813 399 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 ICMTO60725 284 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 HCN1O60741 890 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 C1QBP02746 253 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 PRKAR1AP10644 381 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 FUT5Q11128 374 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 SLC25A30Q5SVS4 291 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 DUSP18Q8NEJ0 188 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 RAET1EQ8TD07 263 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 TDP1Q9NUW8 608 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 SLC23A1Q9UHI7 598 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 KCNE3Q9Y6H6 103 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 CRYZL1O95825 349 aa20.44■□□□□ 0.86
ELL3-201ENST00000319359 SYN1P17600 705 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms