RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 RGNQ15493 299 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 GTDC1Q4AE62 458 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 FAM180BQ6P0A1 224 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM107Q6UX40 140 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 NUP43Q8NFH3 380 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 NKD1Q969G9 470 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 NXPE2Q96DL1 559 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 GIMAP5Q96F15 307 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 FBXL20Q96IG2 436 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 VPS50Q96JG6 964 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 MS4A4EQ96PG1 132 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 MUC13Q9H3R2 512 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 KCND3Q9UK17 655 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 TCFL5Q9UL49 500 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 CFL2Q9Y281 166 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 PTPRBP23467 1997 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 SAGE2PA6NJ88 616 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 CBX7O95931 251 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 CLPSP04118 112 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 ME2P23368 584 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 MMP11P24347 488 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 HTR1EP28566 365 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 MAP3K8P41279 467 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 PRIM2P49643 509 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 GPR143P51810 404 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 OR4D2P58180 307 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 ID2Q02363 134 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 DNASE1L3Q13609 305 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 LTB4RQ15722 352 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 LGI4Q8N135 537 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 MCUR1Q96AQ8 359 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF583Q96ND8 569 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 STACQ99469 402 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 ECSITQ9BQ95 431 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 PRODH2Q9UF12 536 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 C17orf105B2RV13 164 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 TNNI3P19429 210 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 MATN1P21941 496 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 DCAF7P61962 342 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 LIPEQ05469 1076 aa5.49□□□□□ -1.53
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