RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.25■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 HMGN4O00479 90 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 F3P13726 295 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ITGA2P17301 1181 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 NTSP30990 170 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 DUSP7Q16829 419 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 FBXO43Q4G163 708 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 C18orf63Q68DL7 685 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SPATC1Q76KD6 591 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PAQR7Q86WK9 346 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SARGQ9BW04 601 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 EHD3Q9NZN3 535 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR2A25A4D2G3 310 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 AIFM1O95831 613 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 GANABQ14697 944 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 UTS2BQ765I0 119 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 NRROSQ86YC3 692 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR13H1Q8NG92 308 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR10G6Q8NH81 332 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SLC35G5Q96KT7 338 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 FEVQ99581 238 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.24■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 A6NCN8 305 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 TNFRSF10CO14798 259 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 AIREO43918 545 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 NPRL3Q12980 569 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SLC5A8Q8N695 610 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 KCT2Q8NC54 265 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR5D16Q8NGK9 328 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PATE1Q8WXA2 126 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ST6GAL2Q96JF0 529 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ITPAQ9BY32 194 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 NUAK2Q9H093 628 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 M6PRP20645 277 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PRKAG1P54619 331 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 COL19A1Q14993 1142 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 MLC1Q15049 377 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 TTC9Q92623 222 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 APOL4Q9BPW4 351 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR51I1Q9H343 314 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 RLIMQ9NVW2 624 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 STMN3Q9NZ72 180 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 CCDC88CQ9P219 2028 aa20.23■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 A0A1W2PS29 197 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 GSAPA4D1B5 854 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR12D1P0DN82 309 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 XCR1P46094 333 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 YPEL5P62699 121 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 BTN3A2P78410 334 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 GPR18Q14330 331 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 GPR153Q6NV75 609 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 VN1R4Q7Z5H5 301 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 LGI4Q8N135 537 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 FCGR1BQ92637 280 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 RHCGQ9UBD6 479 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SLC28A2O43868 658 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 RECKO95980 971 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 IFNW1P05000 195 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 DUSP2Q05923 314 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PIP5K1AQ99755 562 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 DHRS9Q9BPW9 319 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 RASSF1Q9NS23 344 aa20.22■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 IGHV4-34P06331 123 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 GPR19Q15760 415 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms