RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC29A1Q99808 456 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 RDH14Q9HBH5 336 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FAIMQ9NVQ4 179 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MYH11P35749 1972 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SCO2O43819 266 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 IQCF3P0C7M6 154 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ART1P52961 327 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ACTRT3Q9BYD9 372 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK13Q9HB14 408 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 IL26Q9NPH9 171 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ARNTLO00327 626 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CD70P32970 193 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ARSKQ6UWY0 536 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NAGSQ8N159 534 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GATA6Q92908 595 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCD2Q92925 531 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 BMFQ96LC9 184 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 WASH4PA8MWX3 477 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 H7C417 338 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PCGF2P35227 344 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CPZQ66K79 652 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 HYLS1Q96M11 299 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CCNOP22674 350 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 HTR2AP28223 471 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 LRFN4Q6PJG9 635 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SCD5Q86SK9 330 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A11Q9UPY5 501 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MECP2P51608 486 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FAM189BP81408 668 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NAXEQ8NCW5 288 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 OR7G3Q8NG95 312 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NINJ1Q92982 152 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF597Q96LX8 424 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A3Q99726 388 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 INPP5KQ9BT40 448 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CD3GP09693 182 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GPR89BP0CG08 455 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 BORCS8Q96FH0 119 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ARL6Q9H0F7 186 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 H3BMQ9 156 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GNMTQ14749 295 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NKAPLQ5M9Q1 402 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FIGNL1Q6PIW4 674 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA11Q86U17 422 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 COG8Q96MW5 612 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB126Q9BYW3 111 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GLS2Q9UI32 602 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NPC1O15118 1278 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 C5AR1P21730 350 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GBX1Q14549 363 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ALG10BQ5I7T1 473 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NRMQ8IXM6 262 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 OR52E2Q8NGJ4 325 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A7Q99884 636 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NNATQ16517 81 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CDNFQ49AH0 187 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TFAP2CQ92754 450 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SGCAQ16586 387 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PLBD1Q6P4A8 553 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms