RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LIPIQ6XZB0 460 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GKN2Q86XP6 184 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM129CQ86XR2 697 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 VRK3Q8IV63 474 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 P3H2Q8IVL5 708 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR156Q8NFN8 814 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR7G3Q8NG95 312 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GIPC3Q8TF64 312 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SCAMP4Q969E2 229 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MYDGFQ969H8 173 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB7BQ96AH8 199 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PPCDCQ96CD2 204 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DTD2Q96FN9 168 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PDXPQ96GD0 296 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PKP4Q99569 1192 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CTRCQ99895 268 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DOHHQ9BU89 302 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 EBPLQ9BY08 206 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LHPPQ9H008 270 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MYNNQ9NPC7 610 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GVG6 124 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PPW3 197 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGES3LE9PB15 166 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF11BO00300 401 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 B4GAT1O43505 415 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MPZL2O60487 215 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP20O60882 483 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SCN2BO60939 215 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PDE9AO76083 593 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RASGRP1O95267 797 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf105O95561 183 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMG1P04279 462 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMP1P11279 417 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 IL7RP16871 459 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 IDSP22304 550 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 IMPA1P29218 277 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH4A1P30038 563 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT20P35900 424 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CDKN2CP42773 168 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CRATP43155 626 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RANBP1P43487 201 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 BDKRB1P46663 353 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ENTPD1P49961 510 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G16P53816 162 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 IST1P53990 364 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT3P56703 355 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM11AP58511 58 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBA1BP68363 451 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf80Q0P641 193 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NPRL3Q12980 569 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RGNQ15493 299 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LCTLQ6UWM7 567 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBA1AQ71U36 451 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC80Q76M96 950 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ADCK1Q86TW2 530 aa6.63□□□□□ -1.35
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