RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 AGRPO00253 132 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 QSOX1O00391 747 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GALT4O96024 378 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 VIPP01282 170 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35G4P0C7Q5 338 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TGFBR1P36897 503 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR18Q14330 331 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM48Q8IWZ4 208 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNC2Q96PR1 638 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 FEVQ99581 238 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC38A3Q99624 504 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SCNM1Q9BWG6 230 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CDCA4Q9BXL8 241 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 BRF2Q9HAW0 419 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ADORA3P0DMS8 318 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRB1P18505 474 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SEPHS1P49903 392 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 RBBP4Q09028 425 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMCX4Q5H9R4 360 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf48Q6RUI8 117 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10G2Q8NGC3 310 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6C4Q8NGE1 309 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 RACGAP1Q9H0H5 632 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRN3Q9H3W5 708 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SIAEQ9HAT2 523 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 THSD1Q9NS62 852 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 EVA1BQ9NVM1 165 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS4AQ9UN37 437 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf226A1L170 272 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF24P17028 368 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CD1CP29017 333 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 PDX1P52945 283 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 RGNQ15493 299 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 DESI1Q6ICB0 168 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT22Q9BRQ3 303 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF556Q9HAH1 456 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf14Q9HBI5 128 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 PNLIPP16233 465 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ALOX12P18054 663 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3CBP42338 1070 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH1Q08174 1060 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSM2AQ08AH3 577 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CHIT1Q13231 466 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 MICAQ29983 383 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SYTL3Q4VX76 610 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CPTPQ5TA50 214 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP6Q5VW22 663 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSM2BQ68CK6 577 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF544Q6NX49 715 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC190Q86UF4 302 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC103Q8IW40 242 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4C15Q8NGM1 316 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP4Q96P64 663 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2B2Q9GZK3 357 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 NUAK2Q9H093 628 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFAF4Q9P032 175 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT8P05787 483 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TYRP1P17643 537 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ACADLP28330 430 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 HNF4AP41235 474 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 E2F1Q01094 437 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 IFI44LQ53G44 452 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM159Q96B96 161 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TMCO6Q96DC7 493 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 IMPAD1Q9NX62 359 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFHX4Q86UP3 3567 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CSF2RBP32927 897 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK9P45984 424 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CDCP2Q5VXM1 449 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT10Q86SR1 603 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 PDZD3Q86UT5 571 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT73Q86Y46 540 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SYTL1Q8IYJ3 562 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5AR1Q8NGP9 310 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR20Q8TBZ3 569 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 COQ8BQ96D53 544 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 EBPLQ9BY08 206 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 POT1Q9NUX5 634 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 EHD3Q9NZN3 535 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A14Q9Y267 594 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM172BPA6NC97 362 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT87PA6NCN2 255 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ARRDC5A6NEK1 342 aa24.78■■□□□ 1.56
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