RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SGCZQ96LD1 299 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PROK2Q9HC23 129 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PRODH2Q9UF12 536 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 FLNCQ14315 2725 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 EXPH5Q8NEV8 1989 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ZGRF1Q86YA3 2104 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 POLEQ07864 2286 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SLCO1B7G3V0H7 640 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PEX1O43933 1283 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SLITRK5O94991 958 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 IFI6P09912 130 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CT45A8P0DMV1 189 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CT45A9P0DMV2 189 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CCL3P10147 92 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PRPS1L1P21108 318 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 DRD5P21918 477 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PPICP45877 212 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NTRK2Q16620 822 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CT45A2Q5DJT8 189 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 RTL4Q6ZR62 310 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PAQR8Q8TEZ7 354 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NR4A3Q92570 626 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ESPL1Q14674 2120 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JMM0 328 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPB8 328 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRS3 328 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8OA6NCC3 632 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 TRPC5OSA6NMA1 111 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8NF8WBI6 632 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 TO15178 435 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 GNLYP22749 145 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ABCD3P28288 659 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 GPR85P60893 370 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 MLC1Q15049 377 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NNATQ16517 81 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CAMKMTQ7Z624 323 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SIAH3Q8IW03 269 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 TAGAPQ8N103 731 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 OR10G3Q8NGC4 313 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NTNG2Q96CW9 530 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 BTBD9Q96Q07 612 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 FOLH1BQ9HBA9 442 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 OLAHQ9NV23 265 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NTMQ9P121 344 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NINQ8N4C6 2090 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CNR1P21554 472 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 HPCAL1P37235 193 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 MEOX1P50221 254 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 WNT3P56703 355 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CORO7P57737 925 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 DCAF7P61962 342 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 HSPB3Q12988 150 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CPTPQ5TA50 214 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 DESI1Q6ICB0 168 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PRR22Q8IZ63 422 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 TEX37Q96LM6 180 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 VPS4AQ9UN37 437 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 FRG2CA6NGY1 282 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CRYABP02511 175 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 FBXW4P57775 412 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PHC1P78364 1004 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PSG6Q00889 435 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 EPGNQ6UW88 154 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 GIMAP5Q96F15 307 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms