RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF460Q14592 562 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 PGGHGQ32M88 737 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.77□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 IFNEQ86WN2 208 aa14.77□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PDIK1LQ8N165 341 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ELOA3Q8NG57 546 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DOK4Q8TEW6 326 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC39Q96DD0 335 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.77□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35F4A4IF30 521 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A20A6NK97 555 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CDC7O00311 574 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC3AO75596 197 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TAS2R39P59534 338 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PLIN5Q00G26 463 aa14.76□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 SQLEQ14534 574 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.76□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 NEUROG1Q92886 237 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SERHLQ9NQF3 203 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PP18 115 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 OR6C76A6NM76 312 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TCF21O43680 179 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DYRK3O43781 588 aa14.75□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 ITGA2P17301 1181 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 GSTM2P28161 218 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PTGDSP41222 190 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CREG2Q8IUH2 290 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 BBOF1Q8ND07 529 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD7Q92527 254 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FIG4Q92562 907 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ACTR8Q9H981 624 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CHODLQ9H9P2 273 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SNX15Q9NRS6 342 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PROCRQ9UNN8 238 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 OARD1Q9Y530 152 aa14.75□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 VWFP04275 2813 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 E7ESA3 106 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CDKL1Q00532 357 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DR1Q01658 176 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH1Q08174 1060 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 MGAT5Q09328 741 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FGFBP1Q14512 234 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 NRF1Q16656 503 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.74□□□□□ -0.05
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