RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Adra2cQ01337 458 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kcna7Q17ST2 489 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gbp8Q2V6D6 525 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc16a11Q5NC32 447 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr3Q60879 313 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CmahQ61419 577 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Abcg1Q64343 666 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 BollQ924M5 281 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Chrm3Q9ERZ3 589 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cabin1G3X8Q1 2187 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pcnx1Q9QYC1 2344 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm35060A0A140LIV7 231 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr601A2RS33 314 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 H2-Q1O19441 368 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P01638 115 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 H2-LP01897 362 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Polr1cP52432 346 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Abce1P61222 599 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Alg10bQ3UGP8 474 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cnrip1Q5M8N0 164 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ssxb5Q6XAS2 159 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Crls1Q80ZM8 303 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mief1Q8BGV8 463 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cpne3Q8BT60 533 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 E330017A01RikQ8BU47 192 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nudt9Q8BVU5 350 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Q8C1R3 189 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 C1sbQ8CFG8 688 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cnot6Q8K3P5 557 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 BlmhQ8R016 455 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ntng1Q8R4G0 539 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pcdhga11Q91XY8 933 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gtpbp8Q9CY28 285 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NarfQ9CYQ7 462 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 AvenQ9D9K3 342 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bco1Q9JJS6 566 aa16.85■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 A6H6Q4 206 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Krt90E9Q1Z0 538 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 FkbplO35450 347 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Csnk2a2O54833 350 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp14P10755 501 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sat1P48026 171 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 UbqlnlQ14DL0 610 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dusp5Q1HL35 384 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Abraxas2Q3TCJ1 415 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Serinc4Q5XK03 492 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Timd4Q6U7R4 343 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bdh2Q8JZV9 245 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vps4aQ8VEJ9 437 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Foxj2Q9ES18 565 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slco1a1Q9QXZ6 670 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vmn1r10W4VSP8 311 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hivep2Q3UHF7 2430 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dbil5O09035 87 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 H2afxP27661 143 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mmp2P33434 662 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 DbtP53395 482 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Grxcr2Q3TYR5 254 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fam117bQ3U3E2 584 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ankrd42Q3V096 527 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Osgepl1Q6PEB4 414 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1036Q7TR85 310 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Wdr92Q8BGF3 357 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NarsQ8BP47 559 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gk5Q8BX05 534 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ints14Q8R3P6 515 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mgat5Q8R4G6 740 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lsm1Q8VC85 133 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr437Q8VEV1 310 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Oosp1Q925U0 202 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dhrs4Q99LB2 279 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nsmce3Q9CPR8 279 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fam96aQ9DCL2 160 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kiaa0141Q9DCV6 510 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 ClnkQ9QZE2 435 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gabrg1Q9R0Y8 465 aa16.84■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PtprsB0V2N1 1907 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm17949A0A1B0GRV7 212 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ankle1A8VU90 534 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rnf165E9QAU8 347 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ppm1bP36993 390 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pla2g2cP48076 150 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Coq10bQ3THF9 240 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Stx3Q64704 289 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pamr1Q8BU25 720 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Atxn7l2Q8C8K6 696 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm5111Q8C9M4 190 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rfwd3Q8CIK8 774 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 KptnQ8VCX6 430 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr165Q8VFA2 313 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr229Q8VFN5 307 aa16.83■□□□□ 0.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trim7Q923T7 510 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.4 ms