RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000048026.9

Hoxa11-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa11, Length 2,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Gm4141K9J7H2 306 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 P01629 112 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Srp54P14576 504 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 VaspP70460 375 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Serpina3mQ03734 418 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Rnf43Q5NCP0 784 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Ostf1Q62422 215 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Tas2r140Q7TQA4 312 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Zfand1Q8BFR6 268 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Tmsb15lQ8C0W0 80 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Plac9Q8K262 108 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Fam118aQ91YN1 357 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Timm22Q9CQ85 194 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Pex13Q9D0K1 405 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 PudpQ9D5U5 234 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Olfr938Q9EQ93 315 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Tas2r103Q9JKA3 312 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Clca3a1Q9QX15 902 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f15A0A087WR44 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f12A0A0A0MQP3 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f9A2BFZ7 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f7A2BHG6 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f19A2CG71 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f10A2CG92 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f3A2CGC2 496 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f13B8JKF6 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f2J3QMS5 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f25J3QMV9 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f6J3QMW9 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f26J3QNK2 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f24J3QNQ5 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f8J3QQ50 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f17L7MU81 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f18L7MU83 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Hmox2O70252 315 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Best1O88870 551 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Tuba3aP05214 450 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Ly6aP05533 134 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 LckP06240 509 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 HpcaP84075 193 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f14Q1LZI5 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Kcnk6Q3TBV4 313 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Itpripl2Q3UV16 535 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Chsy3Q5DTK1 884 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Btbd35f27Q5FWA1 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 SynaQ5G5D5 617 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Tvp23aQ6NVH0 222 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Prrg3Q6PAQ9 231 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Cfap206Q6PE87 622 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Atat1Q8K341 421 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 RorbQ8R1B8 470 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 GMCL1P1Q99N64 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Zswim7Q9CWQ2 152 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Slc25a27Q9D6D0 322 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Vmn2r52L7N2B2 852 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Dll3O88516 592 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Rrm2P11157 390 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Ncam1P13595 1115 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 NelfeP19426 375 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Sox14Q04892 240 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Brf2Q3UAW9 420 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Krt76Q3UV17 594 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Smad2Q62432 467 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Ffar1Q76JU9 300 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Slc26a9Q8BU91 790 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Prkd3Q8K1Y2 889 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Olfr818Q8VG46 318 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Slc5a2Q923I7 670 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Spns3Q9D232 514 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Natd1Q9DBW3 110 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Fgf21Q9JJN1 210 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Dock8Q8C147 2100 aa20.45■□□□□ 0.87
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Coq10aE9Q3H6 259 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Gm3239L7N2D9 227 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Rps6ka3P18654 740 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Serpine1P22777 402 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Cmpk2Q3U5Q7 447 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Ag2Q3UPL5 249 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Fcho2Q3UQN2 809 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Cdkn2dQ60773 166 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Tbccd1Q640P7 552 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Olfr1231Q7TQZ8 313 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 UstQ8BUB6 407 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Ptpn7Q8BUM3 359 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Zhx3Q8C0Q2 951 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Gpn2Q8VEJ1 310 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Vmp1Q99KU0 406 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Lrrc18Q9CQ07 262 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Rai1Q61818 1889 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 PlgP20918 812 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 MazP56671 477 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Syt16Q7TN83 639 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Mfn1Q811U4 741 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11-201ENSMUST00000048026 Dlgap2Q8BJ42 1059 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.8 ms