RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 MPEG1Q2M385 716 aa20.25■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 GPR135Q8IZ08 494 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 MS4A8Q9BY19 250 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.25■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.24■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 ZBED5Q49AG3 693 aa20.23■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 OR1L3Q8NH93 324 aa20.23■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 IL3P08700 152 aa20.22■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 C7orf34Q96L11 122 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.22■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 CRYBA2P53672 197 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 VLDLRP98155 873 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 GPR141Q7Z602 305 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 ING2Q9H160 280 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 CACNA1GO43497 2377 aa20.21■□□□□ 0.83
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