RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 LSM1O15116 133 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 LDLRP01130 860 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CCL3P10147 92 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 DUSP8Q13202 625 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TICAM1Q8IUC6 712 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CCT7Q99832 543 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 FAM173AQ9BQD7 235 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TFECO14948 347 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PIP5K1BO14986 540 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 P04436 131 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PCSK2P16519 638 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TACR1P25103 407 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 MPIP34949 423 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 MPP2Q14168 576 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NTRK2Q16620 822 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 XKR7Q5GH72 579 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A10Q63ZE4 541 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 GK5Q6ZS86 529 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 HDXQ7Z353 690 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 DDIASQ8IXT1 998 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 GHDCQ8N2G8 530 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 RELTQ969Z4 430 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 DTX4Q9Y2E6 619 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 A0A0G2JMM0 328 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 A0A1B0GUH1 482 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PPB8 328 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PRS3 328 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 KIR3DP1A8MWS1 328 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CAPN14A8MX76 684 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SERPINE1P05121 402 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 RFC3P40938 356 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NRG3P56975 720 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CES4AQ5XG92 561 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SIMC1Q8NDZ2 872 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 OR52R1Q8NGF1 315 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 AGR3Q8TD06 166 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 EGLN2Q96KS0 407 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 BBS4Q96RK4 519 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CNIH4Q9P003 139 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PRODH2Q9UF12 536 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ZNF835Q9Y2P0 537 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PINLYPA6NC86 204 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TMEM114B3SHH9 223 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 LRRTM2O43300 516 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PLOD3O60568 738 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 RNF224P0DH78 156 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 EMDP50402 254 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CHI3L2Q15782 390 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 FAM9CQ8IZT9 166 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 OR10G3Q8NGC4 313 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ZBTB9Q96C00 473 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 WDR91A4D1P6 747 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 HS6ST1O60243 411 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SLC19A2O60779 497 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 GLSO94925 669 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SLITRK5O94991 958 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SDC1P18827 310 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 DCAF7P61962 342 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CMPK2Q5EBM0 449 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 FAM13CQ8NE31 585 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 HSPBAP1Q96EW2 488 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PPP3R2Q96LZ3 170 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ITPAQ9BY32 194 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TTTY12Q9BZ98 90 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NCKAP5O14513 1909 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 G3V3Y1 287 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ACOX3O15254 700 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TBX19O60806 448 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NAGAP17050 411 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CA7P43166 264 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PER3P56645 1201 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 FOXO1Q12778 655 aa22.91■■□□□ 1.26
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