RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZGLP1P0C6A0 271 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX18P35713 384 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ASCL5Q7RTU5 278 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 EID3Q8N140 333 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ULBP3Q9BZM4 244 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 OLAHQ9NV23 265 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CTSFQ9UBX1 484 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ANGPT4Q9Y264 503 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TCRBV5S2A0A599 114 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 VSTM2BA6NLU5 285 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PLD2O14939 933 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 DYRK3O43781 588 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT36O76013 467 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX11P35716 441 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK6Q00534 326 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SCARB2Q14108 478 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 GNA13Q14344 377 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC73Q6P1J9 531 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SERHL2Q9H4I8 314 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR54Q9H977 334 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAP2Q9NPF8 381 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RX2Q9UBL9 471 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MKL2Q9ULH7 1088 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA16P05015 189 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FTH1P19P0C7X4 201 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ITIH1P19827 911 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC7A1P30825 629 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CASP9P55211 416 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS26P62854 115 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD12Q6NUT3 480 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 EFHD1Q9BUP0 239 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 VN1R1Q9GZP7 353 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 GIN1Q9NXP7 522 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS12A0PJE2 317 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RECKO95980 971 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CD63P08962 238 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CT62P0C5K7 136 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 KDELR2P33947 212 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ERFP50548 548 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MYBPC3Q14896 1274 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RCN1Q15293 331 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 REEP3Q6NUK4 255 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC80Q76M96 950 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PYDC1Q8WXC3 89 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MAL2Q969L2 176 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GNT4Q9C0J1 378 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 DLL1O00548 723 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CEACAM1P13688 526 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF28P17035 718 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ETV5P41161 510 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MAN2A2P49641 1150 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FUT7Q11130 342 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 NSDHLQ15738 373 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 NKG7Q16617 165 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM164Q5U3C3 297 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CDRT4Q8N9R6 151 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF145Q96MT1 663 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PISDQ9UG56 409 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS6KA6Q9UK32 745 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPT1Q9Y234 373 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM186AA6NE01 2351 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf58C9J3I9 102 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TFPTP0C1Z6 253 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 OR12D1P0DN82 309 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 S1PR1P21453 382 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7G1Q8NGA0 311 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTS15Q8TE58 950 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ART5Q96L15 291 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7D2Q96RA2 312 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT2B28Q9BY64 529 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 EXD2Q9NVH0 621 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ANAPC2Q9UJX6 822 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRBP23467 1997 aa28.95■■■□□ 2.23
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