RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.61□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.61□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.61□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 CPED1A4D0V7 1026 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 ISPDA4D126 451 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 OR2AG2A6NM03 316 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 C5orf58C9J3I9 102 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 K7ESM1 405 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 M0R3G1 203 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 AGRPO00253 132 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 KMOO15229 486 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 LRRTM2O43300 516 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SERPINB7O75635 380 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SOX30O94993 753 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 ADAP00813 363 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 IFNW1P05000 195 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 FURINP09958 794 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PCNAP12004 261 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 ADRB3P13945 408 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 RHCEP18577 417 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 DDCP20711 480 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 IDSP22304 550 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 NDUFS1P28331 727 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 GKP32189 559 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 CCR8P51685 355 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 HMGA2P52926 109 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PLA2G16P53816 162 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 CDH15P55291 814 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 WNT3P56703 355 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 NPRL3Q12980 569 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PLCL1Q15111 1095 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PYCR3Q53H96 274 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 XAF1Q6GPH4 301 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 REEP3Q6NUK4 255 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 LRRTM4Q86VH4 590 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 AMZ2Q86W34 360 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 NUDT13Q86X67 352 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PTOV1Q86YD1 416 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 AMER2Q8N7J2 671 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SMYD1Q8NB12 490 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 CHST14Q8NCH0 376 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 GIPC3Q8TF64 312 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 ZNF480Q8WV37 535 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SCAMP4Q969E2 229 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PMEPA1Q969W9 287 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PIP5K1AQ99755 562 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 TEX12Q9BXU0 123 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 OCEL1Q9H607 264 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PIF1Q9H611 641 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 A4GALTQ9NPC4 353 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 V9GYQ6 96 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PRB8 838 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 GSAPA4D1B5 854 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 GABRR3A8MPY1 467 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 TTC34A8MYJ7 566 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-218ENST00000584243 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.59□□□□□ -1.19
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