RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577371.1

RAB31-203, Transcript of RAB31, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB31, Length 272 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB31-203	ENST00000577371	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	RAB7B	Q96AH8	199 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	RCHY1	Q96PM5	261 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	OR4F4	Q96R69	305 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	WDR41	Q9HAD4	459 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	NRN1	Q9NPD7	142 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	POLE3	Q9NRF9	147 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	TBK1	Q9UHD2	729 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		2.54	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	MROH2A	A6NES4	1674 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	SYNM	O15061	1565 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	AGL	P35573	1532 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	JCAD	Q9P266	1359 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371		A0A087WZY1	265 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ASB14	A6NK59	587 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371		H0YL77	283 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	SSX5	O60225	188 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	TSPAN2	O60636	221 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	STK17B	O94768	372 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	TSPY4	P0CV99	314 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	TSPY10	P0CW01	314 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	CD1D	P15813	335 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	POU3F4	P49335	361 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	NDST1	P52848	882 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	NDST2	P52849	883 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	MTTP	P55157	894 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	KRTAP10-5	P60370	271 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	HAND2	P61296	217 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	CALCOCO2	Q13137	446 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	NFATC2	Q13469	925 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	SNX1	Q13596	522 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	LY6D	Q14210	128 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	CCL14	Q16627	93 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	REG3G	Q6UW15	175 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	CES3	Q6UWW8	571 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	GPR142	Q7Z601	462 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	HSCB	Q8IWL3	235 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	CERS5	Q8N5B7	392 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	NCLN	Q969V3	563 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ERP44	Q9BS26	406 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	PARL	Q9H300	379 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	LIME1	Q9H400	295 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ALG9	Q9H6U8	611 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	MED20	Q9H944	212 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	THEG	Q9P2T0	379 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	MBD2	Q9UBB5	411 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		2.53	□□□□□ -2
RAB31-203	ENST00000577371	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RAB31-203	ENST00000577371	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
RAB31-203	ENST00000577371	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RAB31-203	ENST00000577371	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RAB31-203	ENST00000577371	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RAB31-203	ENST00000577371	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
RAB31-203	ENST00000577371	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01

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