RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	AGK	Q53H12	422 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	VWA2	Q5GFL6	755 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	APOOL	Q6UXV4	268 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	MOB2	Q70IA6	237 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ARMCX1	Q9P291	453 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	HCFC1	P51610	2035 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123		A0A0A6YYD4	124 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123		A0A0J9YVX5	310 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF487	B1APH4	448 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123		H3BMH7	237 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SEC22B	O75396	215 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	VENTX	O95231	258 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TGFA	P01135	160 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ETS1	P14921	441 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ACP1	P24666	158 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	IST1	P53990	364 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	MFAP2	P55001	183 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SLC26A5	P58743	744 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	DSCR10	P59022	87 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	STARD6	P59095	220 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	LMO4	P61968	165 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CNST	Q6PJW8	725 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	AMZ2	Q86W34	360 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	KDM8	Q8N371	416 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	BEST4	Q8NFU0	473 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	LHX4	Q969G2	390 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM186	Q96B77	213 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	OR4F4	Q96R69	305 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GPR174	Q9BXC1	333 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ESM1	Q9NQ30	184 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	EMCN	Q9ULC0	261 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	EI24	O14681	340 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF253	O75346	499 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	STAM2	O75886	525 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PDE5A	O76074	875 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	RALA	P11233	206 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	BCL3	P20749	454 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PTPN4	P29074	926 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PRDX2	P32119	198 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SAA4	P35542	130 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ELK3	P41970	407 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	MAGEA4	P43358	317 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	BRCC3	P46736	316 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SGSH	P51688	502 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PARP10	Q53GL7	1025 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	IL23R	Q5VWK5	629 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		2.56	□□□□□ -2

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