RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 AADACL2Q6P093 401 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 AAGABQ6PD74 315 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC25Q86WR0 208 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAPGEF5Q92565 580 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 FRG2BQ96QU4 278 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 XKR8Q9H6D3 395 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 EURLQ9NYK6 297 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 UPB1Q9UBR1 384 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 TINAGQ9UJW2 476 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCA4P78363 2273 aa7.9□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANK2Q01484 3957 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 C17orf100A8MU93 164 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLBP06746 335 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSG1P11464 419 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 FCGR2AP12318 317 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDHA2P29803 388 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARG2P78540 354 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 PMP22Q01453 160 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDK1Q15118 436 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBBP7Q16576 425 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 TEX44Q53QW1 395 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATG9BQ674R7 924 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 CEP97Q8IW35 865 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFAP206Q8IYR0 622 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCTD6Q8NC69 237 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5AR1Q8NGP9 310 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 HAS2Q92819 552 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 FICDQ9BVA6 458 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM153AQ9UHL3 310 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A087X0T9 212 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFNA2P01563 188 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV2-30P06310 120 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM228BP0C875 321 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SKILP12757 684 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAGP20916 626 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 KDELR1P24390 212 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACADLP28330 430 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 PKLRP30613 574 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ART1P52961 327 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSNK1G2P78368 415 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPSM1Q86YR5 675 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC25A28Q96A46 364 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 C8orf44Q96CB5 159 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 CUTCQ9NTM9 273 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 MEMO1Q9Y316 297 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARL5AQ9Y689 179 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 JMJD1CQ15652 2540 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZANQ9Y493 2812 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 DYTNA2CJ06 578 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ASPDHA6ND91 283 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5H15A6NDH6 313 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP2K7O14733 419 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDPCPO95876 746 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERPINA7P05543 415 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 MCM3P25205 808 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMSP52788 366 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 EFNA3P52797 238 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARSFP54793 590 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBPJQ06330 500 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 TFF3Q07654 80 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms