RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558131.1

RPL28-205, Transcript of ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RPL28, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28-205ENST00000558131 NNATQ16517 81 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TMEM198Q66K66 360 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 C8orf74Q6P047 294 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 LACC1Q8IV20 430 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 LIX1Q8N485 282 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 PAFAH2Q99487 392 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 ITPAQ9BY32 194 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 RASSF1Q9NS23 344 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CBLCQ9ULV8 474 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 AHRRA9YTQ3 701 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 B4DXG7 233 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 SNX4O95219 450 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 ACSL3O95573 720 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 PDYNP01213 254 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 ATP1B1P05026 303 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 BMP7P18075 431 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 EIPR1Q53HC9 387 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 NINJ1Q92982 152 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 ZNF681Q96N22 645 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 NODALQ96S42 347 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 FOXC2Q99958 501 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 A8MT66 165 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CAPN14A8MX76 684 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 PPM1BO75688 479 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 KRT38O76015 456 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 RBP1P09455 135 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 NT5EP21589 574 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 UQCRC1P31930 480 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 PHBP35232 272 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 KIR2DL3P43628 341 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 NAGLUP54802 743 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 MAP4K2Q12851 820 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 LTB4RQ15722 352 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 HBEGFQ99075 208 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 JKAMPQ9P055 326 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TMCO1Q9UM00 188 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 PLLPQ9Y342 182 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 C1orf226A1L170 272 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CD8B2A6NJW9 211 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 A6NNC1 897 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 DVL2O14641 736 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 GNB5O14775 395 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 SNPHO15079 494 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 UGT2B11O75310 529 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TRAPPC6AO75865 159 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CTAGE8P0CG41 777 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TSPAN8P19075 237 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 SLCO1A2P46721 670 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 EMDP50402 254 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 MAPK12P53778 367 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 CDH13P55290 713 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 NRG3P56975 720 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 IFT88Q13099 833 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL28-205ENST00000558131 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms