RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 MVB12AQ96EY5 273 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 PIGUQ9H490 435 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 GAREM1Q9H706 876 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 RUBCNLQ9H714 662 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 CUTCQ9NTM9 273 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 MAT2BQ9NZL9 334 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 KLHL3Q9UH77 587 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 U3KQA8 63 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-209ENST00000547449 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 A8MVJ9 347 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 TNFRSF11BO00300 401 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 ARHGAP33O14559 1287 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 PCDHGA12O60330 932 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 OR2B3O76000 313 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 DIRAS1O95057 198 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 TNFAIP8O95379 198 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 RECKO95980 971 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 IFNW1P05000 195 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 CHRM4P08173 479 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 GUSBP08236 651 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 MYF5P13349 255 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 PRKACGP22612 351 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 CSF2RBP32927 897 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 MAP3K8P41279 467 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 OR1E2P47887 323 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 HSD17B7P56937 341 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 MYBPC1Q00872 1141 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 ID2Q02363 134 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 FUT5Q11128 374 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 FAHD1Q6P587 224 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 ZNF605Q86T29 641 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 SHISA5Q8N114 240 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 OR1L3Q8NH93 324 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 PROX1Q92786 737 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 PMM1Q92871 262 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 NAT6Q93015 286 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 PEX11GQ96HA9 241 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 COL21A1Q96P44 957 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 STACQ99469 402 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 PIP5K1AQ99755 562 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 PNPLA3Q9NST1 481 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 C3orf18Q9UK00 162 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 U3KQV3 271 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 C5orf42Q9H799 3197 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 REV3LO60673 3130 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 CPED1A4D0V7 1026 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 SYT5O00445 386 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 SLC16A6O15403 523 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 ZNF749O43361 778 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 HS6ST1O60243 411 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 JRKO75564 520 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 H6PDO95479 791 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-209ENST00000547449 CPNE6O95741 557 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 369.9 ms