RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 CFL2Q9Y281 166 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 PTPN13Q12923 2485 aa20.15■□□□□ 0.82
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PUS1-211ENST00000544662 TACR1P25103 407 aa20.14■□□□□ 0.81
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PUS1-211ENST00000544662 DNASE1L1P49184 302 aa20.14■□□□□ 0.81
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PUS1-211ENST00000544662 DEFB127Q9H1M4 99 aa20.12■□□□□ 0.81
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PUS1-211ENST00000544662 TP53I11O14683 189 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 ITM2AO43736 263 aa20.11■□□□□ 0.81
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PUS1-211ENST00000544662 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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PUS1-211ENST00000544662 LRATO95237 230 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 HSPA4LO95757 839 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 SERPINE1P05121 402 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 ABOP16442 354 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 SDC1P18827 310 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.819e-7■□□□□ 11.2
PUS1-211ENST00000544662 CASP6P55212 293 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 FBXW4P57775 412 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 FOXO1Q12778 655 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 CHI3L2Q15782 390 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 XKR7Q5GH72 579 aa20.11■□□□□ 0.81
PUS1-211ENST00000544662 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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