RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	GTDC1	Q4AE62	458 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	OR2L13	Q8N349	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	THAP4	Q8WY91	577 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	NCLN	Q969V3	563 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	OR10A5	Q9H207	317 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	MAP10	Q9P2G4	905 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CLIC1	O00299	241 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	UPK1A	O00322	258 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	GYG2	O15488	501 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	DDAH2	O95865	285 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CBX7	O95931	251 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	MATN1	P21941	496 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CRAT	P43155	626 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	FUT7	Q11130	342 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CDC20	Q12834	499 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ZSCAN26	Q16670	478 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	HSDL2	Q6YN16	418 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	M1AP	Q8TC57	530 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF721	Q8TF20	911 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ZFP90	Q8TF47	636 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	GATA6	Q92908	595 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	PHF12	Q96QT6	1004 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	POLH	Q9Y253	713 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	SOX30	O94993	753 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	AGR2	O95994	175 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ALOX5	P09917	674 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	MTPN	P58546	118 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	PSME3	P61289	254 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	HPCA	P84074	193 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	SLC25A3	Q00325	362 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	MGAT2	Q10469	447 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	FADD	Q13158	208 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CYP51A1	Q16850	503 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	FHL5	Q5TD97	284 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	RINL	Q6ZS11	566 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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