RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 OR8D2Q9GZM6 311 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 COPS7AQ9UBW8 275 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 PEX12O00623 359 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 PRAMEF2O60811 474 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 COQ9O75208 318 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 UNC5CO95185 931 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 CLPSP04118 112 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ICAM2P13598 275 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 WT1P19544 449 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 MAGEA8P43361 318 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 NUDT2P50583 147 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 VAC14Q08AM6 782 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ART3Q13508 389 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SPDYE7PQ495Y7 208 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SAXO2Q658L1 398 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.878e-7■■■□□ 16.4
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXL4Q9UKA2 621 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 OR6C76A6NM76 312 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP5HO75947 161 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SSTR4P31391 388 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SOAT1P35610 550 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 CPA2P48052 419 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 GTDC1Q4AE62 458 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 NUP43Q8NFH3 380 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 M1APQ8TC57 530 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 GIMAP5Q96F15 307 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 VMP1Q96GC9 406 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 OR10A5Q9H207 317 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 C1orf21Q9H246 121 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 MMP25Q9NPA2 562 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 NDE1Q9NXR1 346 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 CFL2Q9Y281 166 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 EFSO43281 561 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT75O95678 551 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 EMDP50402 254 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 DUSP8Q13202 625 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP1A4Q13733 1029 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 C6orf120Q7Z4R8 191 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 OR52R1Q8NGF1 315 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 OR8J3Q8NGG0 315 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 OR8K3Q8NH51 312 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ELP5Q8TE02 316 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 NCLNQ969V3 563 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 NUDT9Q9BW91 350 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRA2Q9H9E1 313 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 PRODH2Q9UF12 536 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 LAMA5O15230 3695 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 CLIC1O00299 241 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 CPOXP36551 454 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 DOK4Q8TEW6 326 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 VSTM2LQ96N03 204 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 SH3GL1Q99961 368 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-205ENST00000528462 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 B2RBV5 119 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 NKX2-8O15522 239 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 SOX30O94993 753 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC6A2P23975 617 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP3K8P41279 467 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 CLCN2P51788 898 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 MVDP53602 400 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 AP2B1P63010 937 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 TP53BP2Q13625 1128 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 MYBPC3Q14896 1274 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-205ENST00000528462 DCAF10Q5QP82 559 aa20.45■□□□□ 0.86
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