RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0J9YXY3 114 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM86B1E9PN63 330 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DIAPH2O60879 1101 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBBP9O75884 186 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM86B2P0C5J1 330 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD99P14209 185 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HTR1EP28566 365 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMD8P48556 350 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC7A2P52569 658 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HAND2P61296 217 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNG7P62955 275 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCL2L1Q07817 233 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WTAPQ15007 396 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 P2RY14Q15391 338 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEA1Q16626 185 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF674Q2M3X9 581 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALFQ53S48 1182 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C5orf47Q569G3 176 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BMP2KLQ5H9B9 411 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC73Q5JTD7 316 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARMC4Q5T2S8 1044 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAF3Q5VWG9 929 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHBDD2Q6NTF9 364 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZRG5 221 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF165Q6ZSG1 346 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00336Q6ZUF6 198 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAGAPQ8N103 731 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FNDC8Q8TC99 324 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCP11Q8WWU5 503 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM173AQ9BQD7 235 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NACAP1Q9BZK3 213 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM129AQ9BZQ8 928 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM7Q9C029 511 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VIPAS39Q9H9C1 493 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR35Q9P2L0 1181 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF225Q9UK10 706 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCML2Q9UQR0 700 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RFNGQ9Y644 331 aa0.15□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 URADA6NGE7 173 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf94C9JXX5 98 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H0YIG0 161 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCSO14618 274 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NBR2O15453 112 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CBR3O75828 277 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMP10P09238 476 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADRA2CP18825 462 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABRR1P24046 479 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTN2P35609 894 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCR4P51679 360 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VCPP55072 806 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDE7AQ13946 482 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEF2DQ14814 521 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD226Q15762 336 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRY2Q49AN0 593 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PM20D1Q6GTS8 502 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNC5DQ6UXZ4 953 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZS52 159 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FRA10AC1Q70Z53 315 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLFN11Q7Z7L1 901 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CADM2Q8N3J6 435 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC197Q8NCU1 140 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ICA1LQ8NDH6 482 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RFESDQ8TAC1 157 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAF4BQ92750 862 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AK8Q96MA6 479 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOPNLQ96NB1 174 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNPY3Q9BT09 278 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLR3GLQ9BT43 218 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD2Q9GZV1 360 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF350Q9GZX5 532 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALG9Q9H6U8 611 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ESM1Q9NQ30 184 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NANSQ9NR45 359 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPMQ9NSP4 180 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MARCH5Q9NX47 278 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIPGQ9Y5X9 500 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM169AQ9Y6X4 670 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MDN1Q9NU22 5596 aa0.14□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms