RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 BRINP2Q9C0B6 783 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PRDM14Q9GZV8 571 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 LIME1Q9H400 295 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CES1P1Q9UKY3 287 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CAMK2AQ9UQM7 478 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 FREM3P0C091 2139 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 C1orf226A1L170 272 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 GUCY1B2O75343 617 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PPM1BO75688 479 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 IL2RAP01589 272 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 BMP7P18075 431 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TIMP3P35625 211 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 FEN1P39748 380 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PEX19P40855 299 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ZNF136P52737 540 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CDH13P55290 713 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 EIPR1Q53HC9 387 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 FAM219BQ5XKK7 198 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TIGD3Q6B0B8 471 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 RELL1Q8IUW5 271 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 NTNG2Q96CW9 530 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 LRRC46Q96FV0 321 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PAFAH2Q99487 392 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 UGT2B28Q9BY64 529 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 RASSF1Q9NS23 344 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 MAT2BQ9NZL9 334 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 PDYNP01213 254 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 COL6A2P12110 1019 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 NAGAP17050 411 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 TSPAN8P19075 237 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 PTPN6P29350 595 aa15.45■□□□□ 0.06
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HERC3-211ENST00000513325 DUSP2Q05923 314 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 MAP4K2Q12851 820 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 DCST1Q5T197 706 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ADCY4Q8NFM4 1077 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 SELENOMQ8WWX9 145 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 TRIB1Q96RU8 372 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 NODALQ96S42 347 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 FOXC2Q99958 501 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
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HERC3-211ENST00000513325 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 CFL2Q9Y281 166 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 FAM221AA4D161 298 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 C2orf72A6NCS6 295 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 CDH16O75309 829 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 KRT38O76015 456 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 OTCP00480 354 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ATP1B1P05026 303 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 SOX18P35713 384 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 NAGLUP54802 743 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 FAM222BQ8WU58 562 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-211ENST00000513325 NINJ1Q92982 152 aa15.44■□□□□ 0.06
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