RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504292.1

ABCE1-204, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 3

Gene ABCE1, Length 625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-204	ENST00000504292	TMCC2	O75069	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	AGR2	O95994	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CCL4	P13236	92 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CASP14	P31944	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GTF2H1	P32780	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ETV5	P41161	510 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MSH2	P43246	934 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GCLM	P48507	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	RGS7	P49802	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PFN3	P60673	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	STK38	Q15208	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	DHX58	Q96C10	678 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SVIL	O95425	2214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292		B4E171	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MAPK13	O15264	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MED7	O43513	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	DPM1	O60762	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TMEM63A	O94886	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	EML2	O95834	649 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	OR1E1	P30953	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TSPAN7	P41732	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CDH4	P55283	916 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CETN1	Q12798	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MED22	Q15528	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MEP1A	Q16819	746 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	F8	P00451	2351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292		A0A0J9YWU9	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	RAD51B	O15315	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	DUX1	O43812	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	KLHL41	O60662	606 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	STK17B	O94768	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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