RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
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RABGEF1-211ENST00000503687 NEK6Q9HC98 313 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-211ENST00000503687 SEC14L4Q9UDX3 406 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-211ENST00000503687 BRWD1Q9NSI6 2320 aa12.12□□□□□ -0.47
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RABGEF1-211ENST00000503687 EN2P19622 333 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
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RABGEF1-211ENST00000503687 B3GALT2O43825 422 aa12.1□□□□□ -0.47
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RABGEF1-211ENST00000503687 WSCD2Q2TBF2 565 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-211ENST00000503687 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
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