RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 A8MU76 341 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 ANHXE9PGG2 379 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TFECO14948 347 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGEF9O43307 516 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CSO75390 466 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 FGF19O95750 216 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TPBGLP0DKB5 382 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC192P0DO97 292 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 ID1P41134 155 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 PITPNBP48739 271 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CASP9P55211 416 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM50BP56557 158 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 ERVK-16P61578 105 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 HERV-K104P63124 156 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 Q7L0L9 218 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 MIER3Q7Z3K6 550 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CACUL1Q86Y37 369 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 HSCBQ8IWL3 235 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 DEFB123Q8N688 67 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 LEMD2Q8NC56 503 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 OR4L1Q8NH43 312 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 LIPHQ8WWY8 451 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 NR4A3Q92570 626 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 PCED1BQ96HM7 432 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 AGAP4Q96P64 663 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 SSX3Q99909 188 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 AGPAT1Q99943 283 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 PIGVQ9NUD9 493 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 MIS18AQ9NYP9 233 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 PHIPQ8WWQ0 1821 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 PIEZO1Q92508 2521 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 SERINC4A6NH21 518 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 SHISA7A6NL88 538 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 KPNA7A9QM74 516 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 K7EQD1 137 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 BBOX1O75936 387 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 ZFAND5O76080 213 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 ANGPTL1O95841 491 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 SLC4A1P02730 911 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM49P0CI25 452 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM49CP0CI26 452 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 PCP11498 1178 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 MYOGP15173 224 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CD1DP15813 335 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CYP3A5P20815 502 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 GPX3P22352 226 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 MSNP26038 577 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 RPL9P32969 192 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CCR4P51679 360 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 PARP10Q53GL7 1025 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 RTL6Q6ICC9 239 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM65Q6PJ69 517 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 BATF2Q8N1L9 274 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 TCP11Q8WWU5 503 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 GLYATL1Q969I3 302 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 RUNDC3BQ96NL0 473 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 IWS1Q96ST2 819 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 SYT11Q9BT88 431 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1B-215ENST00000498054 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
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