RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPR142	Q7Z601	462 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR4L1	Q8NH43	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	GLYATL1	Q969I3	302 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	SNX21	Q969T3	373 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CAPNS2	Q96L46	248 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CHEK1	O14757	476 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	HDAC3	O15379	428 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	LYPD3	O95274	346 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	SERPINF2	P08697	491 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	FCAR	P24071	287 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	NDST1	P52848	882 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CXCL6	P80162	114 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CD47	Q08722	323 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRT35	Q92764	455 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	BIRC7	Q96CA5	298 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAF2	Q96CS3	445 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CABS1	Q96KC9	395 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	IL17C	Q9P0M4	197 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	MTRR	Q9UBK8	725 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	EMCN	Q9ULC0	261 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619		A8MX80	341 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	TSC22D2	O75157	780 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	PNP	P00491	289 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	PVR	P15151	417 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	B4GALT1	P15291	398 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	UCP1	P25874	307 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACADSB	P45954	432 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	HLCS	P50747	726 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	P2RY4	P51582	365 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	SMS	P52788	366 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	NPRL3	Q12980	569 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	TGIF1	Q15583	401 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	EPC2	Q52LR7	807 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	IFI44L	Q53G44	452 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	C2orf83	Q53S99	150 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAPH1	Q70E73	1250 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	STH	Q8IWL8	128 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	SFRP1	Q8N474	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	COG3	Q96JB2	828 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	C9orf85	Q96MD7	179 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	DPM3	Q9P2X0	92 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRODH2	Q9UF12	536 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CYB561D2	O14569	222 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CFLAR	O15519	480 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	GSTA1	P08263	222 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPA4	Q13156	261 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRT31	Q15323	416 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	HFE	Q30201	348 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	CASD1	Q96PB1	797 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPR174	Q9BXC1	333 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM245	Q9H330	911 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	PTPRU	Q92729	1446 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A0A6YYD4	124 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	EI24	O14681	340 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	OLFM2	O95897	454 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGHG3	P01860	377 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NCKAP1-208	ENST00000495619	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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