RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 VWA5B2Q8N398 1253 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 NEIL3Q8TAT5 605 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 DIO2Q92813 273 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ANGPTL4Q9BY76 406 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 LDAHQ9H6V9 325 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 VPS29Q9UBQ0 182 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 Q9UFV3 132 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 EMCNQ9ULC0 261 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA8RI6L899 631 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 WDR1O75083 606 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 GUCY1B2O75343 617 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 CBX7O95931 251 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 TAC1P20366 129 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ABCD3P28288 659 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 TBCELQ5QJ74 424 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 SH2D5Q6ZV89 423 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 PRR22Q8IZ63 422 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ACPTQ9BZG2 426 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ACAD8Q9UKU7 415 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf185Q5T7R7 199 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 DESI1Q6ICB0 168 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 SEM1Q6ZVN7 128 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 LIX1LQ8IVB5 337 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ACMSDQ8TDX5 336 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF597Q96LX8 424 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 RILPQ96NA2 401 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ITPAQ9BY32 194 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 GSTO2Q9H4Y5 243 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 MCM8Q9UJA3 840 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA6L10A6NI86 522 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 CAPN14A8MX76 684 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 TP53I11O14683 189 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 RHOXF2BP0C7M4 288 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 CASP3P42574 277 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 LTB4RQ15722 352 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 WLSQ5T9L3 541 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL29Q96CT2 875 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 RHOXF2Q9BQY4 288 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 BRINP2Q9C0B6 783 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 KCNJ16Q9NPI9 418 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 NMRK1Q9NWW6 199 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 F8P00451 2351 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 FOXO6A8MYZ6 492 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 KRT6AP02538 564 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 KRT6BP04259 564 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 GSTA1P08263 222 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 PYGBP11216 843 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 KRT6CP48668 564 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 EMDP50402 254 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 NNATQ16517 81 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 HGDQ93099 445 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 KCNA7Q96RP8 456 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 PLLPQ9Y342 182 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PPM1 405 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 G3V2L1 256 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 HPNP05981 417 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 GDF1P27539 372 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 PTGDSP41222 190 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 TRPC1P48995 793 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 TMED10P49755 219 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 NRG3P56975 720 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 TLE4Q04727 773 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 LCP2Q13094 533 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM198Q66K66 360 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM81Q6P7N7 255 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A9Q8IVM8 553 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 ULK2Q8IYT8 1036 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 METTL6Q8TCB7 284 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 APIPQ96GX9 242 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 GNRHR2Q96P88 292 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 EXO5Q9H790 373 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 MCCC2Q9HCC0 563 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 C15orf41Q9Y2V0 281 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 SPG11Q96JI7 2443 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-211ENST00000490677 PCNX3Q9H6A9 2034 aa25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.5 ms