RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490308.1

EPB41-212, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1, humanhuman

TSL 3

Gene EPB41, Length 354 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41-212ENST00000490308 SAR1BQ9Y6B6 198 aa2.51□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ABCC8Q09428 1581 aa2.51□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 FGD5Q6ZNL6 1462 aa2.51□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 HEG1Q9ULI3 1381 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 SH3TC1Q8TE82 1336 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 SMARCA2P51531 1590 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 A0A1W2PP11 408 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ZNF840PA6NDX5 716 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 OR5K3A6NET4 321 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 UNC119BA6NIH7 251 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 OR6C65A6NJZ3 312 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 C2CD4BA6NLJ0 364 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 NPIPA5E9PKD4 350 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 NR5A2O00482 541 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 SDHDO14521 159 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 DYNC1I1O14576 645 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ABCD4O14678 606 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 KLF11O14901 512 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 FOXN1O15353 648 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ADAM12O43184 909 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 DFNA5O60443 496 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 RFPL2O75678 378 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 TM7SF2O76062 418 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 STK17BO94768 372 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 CDK14O94921 469 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 AP2A2O94973 939 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 LRATO95237 230 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 AHSA1O95433 338 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 EML2O95834 649 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ECDO95905 644 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 B4GALT1P15291 398 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ARSBP15848 533 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 NAGAP17050 411 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 TBXA2RP21731 343 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 CA4P22748 312 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 AADACP22760 399 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 CCKBRP32239 447 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 IFNA8P32881 189 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 PIGAP37287 484 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ATP12AP54707 1039 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 SLURP1P55000 103 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 CTAG1AP78358 180 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ZXDAP98168 799 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ZXDBP98169 803 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 PAX5Q02548 391 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 GPR50Q13585 617 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 PTPN20Q4JDL3 420 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 TMEM119Q4V9L6 283 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 SBK1Q52WX2 424 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 LGSNQ5TDP6 509 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 AGBL2Q5U5Z8 902 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 PLPP4Q5VZY2 271 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 LIPJQ5W064 366 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 SLC25A25Q6KCM7 469 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 H3F3CQ6NXT2 135 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 CEACAM20Q6UY09 585 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 DEF8Q6ZN54 512 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 PRR23BQ6ZRT6 265 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ZNF554Q86TJ5 538 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 PTOV1Q86YD1 416 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 MARCH9Q86YJ5 346 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 CCDC65Q8IXS2 484 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 MMD2Q8IY49 270 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 DHRSXQ8N5I4 330 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 MAB21L3Q8N8X9 362 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 CCDC197Q8NCU1 140 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 TMEM104Q8NE00 496 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 OR4K14Q8NGD5 310 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 NDNFQ8TB73 568 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 FCAMRQ8WWV6 532 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 SUSD6Q92537 303 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ELMO1Q92556 727 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 SLCO2A1Q92959 643 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ZG16BQ96DA0 208 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 NUS1Q96E22 293 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 NSL1Q96IY1 281 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 CXorf58Q96LI9 332 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 DEFB118Q96PH6 123 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 MTMR9Q96QG7 549 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 OR1F2PQ96R84 312 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 IL12RB2Q99665 862 aa2.5□□□□□ -2.01
EPB41-212ENST00000490308 AGPAT1Q99943 283 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms