RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482190.1

RBBP4-212, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-212ENST00000482190 SLCO2A1Q92959 643 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 ZNF653Q96CK0 615 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 SNF8Q96H20 258 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 ACCSQ96QU6 501 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 NUP85Q9BW27 656 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 DPEP2Q9H4A9 486 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 LRRC19Q9H756 370 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 DYRK4Q9NR20 520 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 SEC14L3Q9UDX4 400 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 LGALS13Q9UHV8 139 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-212ENST00000482190 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 FAM170AA1A519 330 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 B4DGG1 531 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 ANKRD63C9JTQ0 380 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 E7ENQ6 273 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 SOCS6O14544 535 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 WNT9BO14905 357 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 ALOX15BO15296 676 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 HS6ST1O60243 411 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 SLC19A2O60779 497 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 CDH16O75309 829 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 DCTN3O75935 186 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 RGS11O94810 467 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 NKX2-2O95096 273 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 TNFP01375 233 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 HMBSP08397 361 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 DLATP10515 647 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 NR2F1P10589 423 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 CCNB1P14635 433 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 TAC1P20366 129 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 SAT1P21673 171 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 LMO2P25791 158 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 ALDH3A1P30838 453 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 GCKP35557 465 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 CETN2P41208 172 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 PIK3CAP42336 1068 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 PGFP49763 221 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 ENTPD1P49961 510 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 CCNG1P51959 295 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 C21orf58P58505 322 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 NAE1Q13564 534 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 SNX1Q13596 522 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 PTGR1Q14914 329 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 C3AR1Q16581 482 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 PARP6Q2NL67 630 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 MPP7Q5T2T1 576 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 NKAIN2Q5VXU1 208 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 ASRGL1Q7L266 308 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 TAF8Q7Z7C8 310 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 NOXA1Q86UR1 476 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 VSIG1Q86XK7 387 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 C12orf56Q8IXR9 622 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 FAM71AQ8IYT1 594 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 LRRC52Q8N7C0 313 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 XXYLT1Q8NBI6 393 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 LMO3Q8TAP4 145 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 C1orf54Q8WWF1 131 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 SPDL1Q96EA4 605 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 BICD1Q96G01 975 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 FCRL4Q96PJ5 515 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 KCNK16Q96T55 309 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 PCDHB18PQ96TA0 734 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 TKTL2Q9H0I9 626 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-212ENST00000482190 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.9 ms